CASB厌氧生物反应器中A区是主反应区，进水与反应器中的厌氧生物菌在该区充分混合并反应，是反应器的主要产沼气区。在A区，厌氧生物菌和进水混合物随沼气向上移动，水质逐渐被净化，到达B区时，进水中有机物已经大部分得到降解，产气量明显降低。在B区，A区所产沼气被分离出来由沼气管排出，厌氧生物菌和水流夹带着少量的沼气进入C区。C区是副反应区，在C区，水中有机物进一步被厌氧生物菌降解，有少量产气，比重较大的厌氧生物菌直接落入A区，比重较小的厌氧生物菌附着着少量沼气随出水到达三相分离器。在经过三相分离器时，沼气被分离出来通过沼气管排出，比重较大的厌氧生物菌重新回到C区，比重较小的厌氧生物菌则随出水到达D区。在D区，比重较大的厌氧生物菌会形成一个不稳定的厌氧床继续降解有机物，比重较小的厌氧生物菌则随出水排出反应器。
如图1所示，A区与B区、B区与C区、C区与A区之间分别有一竖向通道，三个通道中，A区与B区通道内的沼气含量远远高于其余两通道，从而A区与B通道区内的混合液比重也远远小于其余两通道，由此使A区与C区之间产生了压力差，C区压力大于A区，因此C区的厌氧生物菌和水就重新回到A区，从而产生了由A区到B区、B区到C区、C区再回到A区的内循环。
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